戦国時代、山口県を拠点に天下統一を果たそうとした萌利元就（もうりもとなり）の眠る菩提寺、萌春寺。
由緒正しいこのお寺には、県外からも多くの参拝客の姿があったが、謎の妖精コロナちゃんの襲来により、今では参拝客の姿は1人もいなくなってしまった。
このままでは私たちのごはん・・・ではなく、萌利元就様が安心して眠れない。マルちゃんは大好きなお師匠様から萌利家に代々伝わる三萌の矢（さんほうのや）と呼ばれる【数珠】【警策】【御朱印】を授かると、まずは山口県に蔓延るコロナちゃんを改心させ、再び山口県を活性化させよと無理難題を言いつけられる。渋々旅に出るマルちゃんは、地元の人たちを巻き込んでは、ドタバタ騒ぎを繰り広げるのであった・・・。